Ça dépend en fait. Par exemple, Secret of Mana 2 n'est jamais sorti en dehors du Japon (seiken densetsu 3 si je dis pas de bêtises ? Qu'on me corrige au cas où).
Donc là effectivement, il faut sacrifier une autre cartouche afin de créer celle-là (SOM2). Quant aux jeux existants réellement MMX2 ou MMX3, il me semble que dans ce cas, ce sont tout simplement des copies (reproduction identique ou presque), mais ça se voit principalement sur la boite (texture/couleur etc) et à l'intérieur de la cartouche (mais pour ça faut s'y connaître un minimum et fouiller).
Quant à la rareté, c'est pas vraiment rare en soi. Par exemple, pour un FF III NES, faut avoir un Super Mario Bros 3 Rev + un autre jeu, donc la création requiert d'autres jeux, mais là c'est un cas particulier car un Super Mario Bros 3 Rev A, c'est la merde à trouver (d'ailleurs j'en cherche 1, si une âme charitable veut faire un don xD). Mais globalement, pour les autres cartmod, les jeux requis sont pas inaccessibles, donc non, y'a rien de rare là-dedans, si ce n'est qu'il y en a pas beaucoup d'exemplaire (voire les cartmods de Kogami pour comprendre).
Si je me suis trompé, faites vous plaisir et corrigez moi, mais je pense pas être loin de la vérité.